Sete equipes de trabalho distribuídas em todo o território nacional participam das atividades da Obsma. São seis coordenações regionais sediadas nas unidades técnico-científicas da Fiocruz em Belo Horizonte, Brasília, Manaus, Recife, Rio de Janeiro e Salvador, além de uma coordenação nacional instalada no Campus de Manguinhos, na capital fluminense, onde está localizada a Vice-presidência de Educação, Informação e Comunicação, responsável pela execução financeira e administrativa do projeto. Ao todo, na Fiocruz, participam da iniciativa nove unidades técnico-científicas, cinco diretorias técnico-administrativas, dois escritórios regionais e três vice-presidências. A equipe de coordenação da OBSMA é formada por 19 profissionais – entre pesquisadores e assistentes – distribuídos nas coordenações sediadas nas unidades da Fiocruz. Em suas atividades de divulgação e formação de professores, a OBSMA conta com cerca de 70 profissionais colaboradores vinculados a instituições de ensino, ciência e tecnologia.